143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4936 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008759  Pnap_4936  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  273  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12869  normal  0.393029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4096  transposase, IS4 family protein  77.27 
 
 
294 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0702  transposase, IS4 family protein  48.18 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0762  transposase  47.12 
 
 
293 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1703  transposase  47.12 
 
 
293 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2981  transposase, IS4  45.1 
 
 
295 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0340477  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3399  transposase, IS4  45.1 
 
 
295 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3002  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2863  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0192  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.56345  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0158  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0495  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0643  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0818501  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0097  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2874  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0260  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0041  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0465  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0419  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0689  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0008  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.919788  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0809  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0778  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0038  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0201  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.939857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0286  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0317  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0444  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0744  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.506929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0862  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0917  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0959  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0972  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1051  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1218  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1276  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.623612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1339  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1348  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1365  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1410  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1441  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.363136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1459  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1522  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1601  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.174861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1605  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1652  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1692  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.250991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1777  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.167133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1993  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2015  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2051  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2070  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2251  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2323  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2394  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2430  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2543  transposase  46.15 
 
 
293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2721  transposase  45.19 
 
 
293 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2597  transposase  45.19 
 
 
293 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0112  transposase  45.19 
 
 
293 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1209  transposase  45.19 
 
 
293 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1088  transposase, IS4  44.12 
 
 
295 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000830574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1205  transposase, IS4  44.12 
 
 
295 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00139369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1928  transposase, IS4  44.12 
 
 
295 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2456  transposase, IS4  44.12 
 
 
295 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2700  transposase, IS4  44.12 
 
 
295 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00130317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3116  transposase, IS4  44.12 
 
 
295 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2469  transposase  45.19 
 
 
293 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0069  transposase, IS4 family protein  44 
 
 
299 aa  103  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1008  transposase, putative  48.04 
 
 
292 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0194  ISPg3, transposase  43.24 
 
 
300 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.818516 
 
 
-
 
NC_002950  PG0261  ISPg3, transposase  43.24 
 
 
300 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0798  ISPg3, transposase  43.24 
 
 
300 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1032  ISPg3, transposase  43.24 
 
 
300 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104806 
 
 
-
 
NC_002950  PG1262  ISPg3, transposase  44.14 
 
 
300 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4143  transposase, IS4 family protein  44.12 
 
 
293 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0590927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0165  hypothetical protein  39.78 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1470  transposase IS4 family protein  43.75 
 
 
293 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0460218  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3086  transposase, putative  49.28 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1538  transposase, IS4  39.34 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1315  transposase  28 
 
 
296 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1380  transposase  28 
 
 
296 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.389447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1520  transposase  28 
 
 
296 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00361102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0423  transposase  28.46 
 
 
296 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0483061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0733  transposase  28.46 
 
 
284 aa  42.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0117119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0919  transposase  28.46 
 
 
296 aa  42.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00272522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0996  transposase  28.46 
 
 
296 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.440255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1346  transposase  28.46 
 
 
296 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000526235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1841  transposase  28.46 
 
 
296 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.353065  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1339  transposase  28.46 
 
 
284 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.179183  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1414  transposase  28 
 
 
296 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.184342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1723  transposase  27.64 
 
 
296 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0603251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2798  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
292 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0728  transposase  27.2 
 
 
296 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3599  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
292 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0109745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1857  transposase  27.64 
 
 
263 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1954  transposase  27.2 
 
 
296 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.386926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2018  transposase  27.2 
 
 
296 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2350  transposase  27.2 
 
 
296 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0709074  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1437  transposase  27.64 
 
 
296 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000448786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>