82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1538 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1538  transposase, IS4  100 
 
 
144 aa  301  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0069  transposase, IS4 family protein  87.23 
 
 
299 aa  261  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3399  transposase, IS4  56.03 
 
 
295 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2981  transposase, IS4  56.03 
 
 
295 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0340477  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2456  transposase, IS4  55.32 
 
 
295 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3116  transposase, IS4  55.32 
 
 
295 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2700  transposase, IS4  55.32 
 
 
295 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00130317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1088  transposase, IS4  55.32 
 
 
295 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000830574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1205  transposase, IS4  55.32 
 
 
295 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00139369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1928  transposase, IS4  55.32 
 
 
295 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2469  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1692  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.250991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1652  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1605  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1601  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.174861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1522  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1459  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1777  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.167133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1993  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2015  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2051  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2070  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2251  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2323  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2394  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2430  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0008  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.919788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2543  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2863  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2874  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3002  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1348  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0041  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0097  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0158  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0192  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.56345  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0260  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0419  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0465  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0495  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0643  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0818501  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0689  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0917  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0778  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0038  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0201  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.939857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0286  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0317  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0444  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0744  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.506929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0862  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0959  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0972  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1051  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1218  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1276  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.623612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1339  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0809  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1365  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1441  transposase  56.74 
 
 
293 aa  176  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.363136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1209  transposase  56.03 
 
 
293 aa  174  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2597  transposase  56.03 
 
 
293 aa  174  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2721  transposase  56.03 
 
 
293 aa  174  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0112  transposase  56.03 
 
 
293 aa  174  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1703  transposase  56.03 
 
 
293 aa  173  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0762  transposase  56.03 
 
 
293 aa  173  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1410  transposase  56.03 
 
 
293 aa  173  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1008  transposase, putative  55.15 
 
 
292 aa  167  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0165  hypothetical protein  47.52 
 
 
291 aa  137  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0702  transposase, IS4 family protein  46.81 
 
 
289 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1470  transposase IS4 family protein  45.77 
 
 
293 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0460218  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4096  transposase, IS4 family protein  41.13 
 
 
294 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4143  transposase, IS4 family protein  40.43 
 
 
293 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0590927  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1032  ISPg3, transposase  38.3 
 
 
300 aa  103  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104806 
 
 
-
 
NC_002950  PG0798  ISPg3, transposase  38.3 
 
 
300 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0261  ISPg3, transposase  38.3 
 
 
300 aa  101  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0194  ISPg3, transposase  38.3 
 
 
300 aa  101  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.818516 
 
 
-
 
NC_002950  PG1262  ISPg3, transposase  37.59 
 
 
300 aa  96.7  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3347  putative transposase  47.95 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2770  transposase, IS4  47.95 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.164785  normal  0.0650092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3086  transposase, putative  47.17 
 
 
69 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4936  hypothetical protein  39.34 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12869  normal  0.393029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>