237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2456 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2456  transposase, IS4  100 
 
 		 295 aa  617  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1088  transposase, IS4  99.66 
 
 		 295 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000830574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1205  transposase, IS4  99.66 
 
 		 295 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00139369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1928  transposase, IS4  99.32 
 
 		 295 aa  613  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2700  transposase, IS4  99.66 
 
 		 295 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00130317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3116  transposase, IS4  99.66 
 
 		 295 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3399  transposase, IS4  98.64 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2981  transposase, IS4  98.31 
 
 		 295 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0340477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1008  transposase, putative  80.07 
 
 		 292 aa  502  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4143  transposase, IS4 family protein  72.54 
 
 		 293 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0590927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1365  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1276  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.623612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1441  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.363136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1522  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1601  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.174861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1459  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1348  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1339  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1218  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0317  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0444  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0038  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0201  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.939857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0972  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1051  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0069  transposase, IS4 family protein  59.11 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1652  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0917  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0959  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0286  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0862  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0744  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.506929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2051  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.687702  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0643  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0818501  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1993  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2874  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0809  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3002  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0008  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.919788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2394  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0041  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0097  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2430  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.275701  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0158  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0192  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.56345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2469  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0260  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2543  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2251  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1605  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1692  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.250991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1777  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.167133  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0419  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0465  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2323  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2863  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2070  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2015  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0495  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0689  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0778  transposase  59.45 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1410  transposase  59.11 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1209  transposase  59.11 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0112  transposase  59.11 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1703  transposase  59.11 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2597  transposase  59.11 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2721  transposase  59.11 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0762  transposase  59.11 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4096  transposase, IS4 family protein  46.15 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0165  hypothetical protein  48.41 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0702  transposase, IS4 family protein  46.1 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_002950  PG0798  ISPg3, transposase  44.56 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0261  ISPg3, transposase  44.56 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1032  ISPg3, transposase  44.56 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104806 
 
 
-
 
NC_002950  PG1262  ISPg3, transposase  44.91 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0194  ISPg3, transposase  44.21 
 
 		 300 aa  261  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.818516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1470  transposase IS4 family protein  41.75 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0460218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1538  transposase, IS4  55.32 
 
 		 144 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3086  transposase, putative  86.96 
 
 		 69 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4936  hypothetical protein  44.12 
 
 		 131 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12869  normal  0.393029 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1723  transposase  31.43 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0603251  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3347  putative transposase  47.3 
 
 		 77 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2770  transposase, IS4  47.3 
 
 		 77 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.164785  normal  0.0650092 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0919  transposase  31.43 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00272522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0423  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0483061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0990  transposase  31.43 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0057  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.033451  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0996  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.440255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1520  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00361102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1841  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.353065  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D34  transposase  31.43 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0159286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0070  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00361102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0675  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10833  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0710  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.987905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0733  transposase  30.95 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0117119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1516  transposase  30.77 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000441669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1738  transposase  30.77 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0265447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1989  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.588662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2007  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2350  transposase  30.95 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0709074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>