228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2018 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0728  transposase  100 
 
 
296 aa  613  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2018  transposase  100 
 
 
296 aa  613  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1954  transposase  99.66 
 
 
296 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.386926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2350  transposase  99.66 
 
 
296 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0709074  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0350  transposase  98.99 
 
 
296 aa  607  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.676447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0679  transposase  99.32 
 
 
296 aa  608  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00272522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0958  transposase  98.99 
 
 
296 aa  608  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2007  transposase  98.99 
 
 
296 aa  607  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2035  transposase  99.32 
 
 
296 aa  608  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0151047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2203  transposase  98.99 
 
 
296 aa  607  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00928049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2462  transposase  99.32 
 
 
296 aa  608  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C45  transposase  98.99 
 
 
296 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0057  transposase  98.65 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.033451  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0376  transposase  98.65 
 
 
296 aa  604  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0527454  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0476  transposase  98.99 
 
 
296 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0675  transposase  98.65 
 
 
296 aa  603  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10833  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0710  transposase  98.99 
 
 
296 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.987905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0801  transposase  98.99 
 
 
296 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0924  transposase  98.65 
 
 
296 aa  604  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0448539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0943  transposase  98.65 
 
 
296 aa  603  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000548004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0996  transposase  98.65 
 
 
296 aa  603  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.440255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1227  transposase  98.65 
 
 
296 aa  604  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00543475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1516  transposase  98.65 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000441669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1520  transposase  98.99 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00361102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1738  transposase  98.65 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0265447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1841  transposase  98.99 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.353065  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1989  transposase  98.65 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.588662  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D34  transposase  97.97 
 
 
296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0159286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0070  transposase  98.65 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00361102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0990  transposase  98.65 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1315  transposase  98.31 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1380  transposase  98.31 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.389447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1414  transposase  98.65 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.184342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1437  transposase  98.31 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000448786  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2066  transposase  98.31 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2303  transposase  98.31 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000726032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2313  transposase  98.65 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.101441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2360  transposase  98.65 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.398217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2428  transposase  98.65 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D22  transposase  97.97 
 
 
296 aa  599  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0286  transposase  97.97 
 
 
296 aa  598  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0205191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0423  transposase  97.97 
 
 
296 aa  598  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0483061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1346  transposase  97.97 
 
 
296 aa  598  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000526235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1723  transposase  97.97 
 
 
296 aa  598  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0603251  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1943  transposase  97.97 
 
 
296 aa  599  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000687064  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C05  transposase  97.3 
 
 
296 aa  596  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0919  transposase  97.64 
 
 
296 aa  594  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00272522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1751  transposase  96.28 
 
 
292 aa  586  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2211  transposase  99.64 
 
 
284 aa  568  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0151047  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D36  transposase  98.91 
 
 
284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0652132  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1162  transposase  98.54 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0733  transposase  97.45 
 
 
284 aa  556  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0117119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1339  transposase  97.81 
 
 
284 aa  555  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.179183  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1857  transposase  98.1 
 
 
263 aa  537  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1514  transposase  98.07 
 
 
259 aa  529  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0022783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2727  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1842  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3267  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0878  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2666  transposase IS4 family protein  37.6 
 
 
292 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000825775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2012  transposase IS4 family protein  37.6 
 
 
292 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0250  transposase IS4 family protein  37.6 
 
 
292 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1672  transposase IS4 family protein  37.6 
 
 
292 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3382  transposase IS4 family protein  37.6 
 
 
292 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0393001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3325  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0303037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2950  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000202826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2768  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0213708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3350  transposase IS4 family protein  36.8 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1807  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2055  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.862347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2701  transposase IS4 family protein  36.8 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3189  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0656  transposase IS4 family protein  36.8 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2062  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000149012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1443  transposase IS4 family protein  36.8 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3432  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0703  transposase IS4 family protein  36.8 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3335  transposase IS4 family protein  37.2 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0310  transposase IS4 family protein  36.8 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1925  transposase IS4 family protein  36 
 
 
292 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3599  transposase IS4 family protein  36.4 
 
 
292 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0109745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2798  transposase IS4 family protein  36.4 
 
 
292 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2070  transposase IS4 family protein  34.15 
 
 
292 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1387  transposase IS4 family protein  34.2 
 
 
288 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1713  transposase IS4  28.8 
 
 
279 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2483  transposase, IS4  29.13 
 
 
293 aa  99  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4096  transposase, IS4 family protein  33.02 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0359  IS4 family transposase  29 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.441685  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0407  IS4 family transposase  29 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547418 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0414  IS4 family transposase  29 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0545  IS4 family transposase  29 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0933  IS4 family transposase  29 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.148656  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0944  IS4 family transposase  29 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1427  IS4 family transposase  29 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.716221  normal  0.315451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1490  IS4 family transposase  29 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.495373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1748  IS4 family transposase  29 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.7477  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2086  IS4 family transposase  29 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1008  transposase, putative  32.86 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1410  transposase  28.46 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2469  transposase  29.07 
 
 
293 aa  92.4  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>