56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2500 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 47 aa  97.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  63.41 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  58.14 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  58.97 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  58.97 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  55 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  55 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  55.81 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  56.1 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  57.14 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  52.38 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  53.66 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  53.66 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  50 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  53.66 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  51.22 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  52.5 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  52.5 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  53.49 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  57.14 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  53.66 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  48.84 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  53.85 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  50 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  46.34 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  55.56 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  53.85 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  46.34 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  52.5 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  53.66 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  47.73 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  48.84 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  47.73 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  46.67 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  46.51 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  50 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  50 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  48.72 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  55 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  51.28 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2721  PilT protein-like protein  54.05 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  50 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  45.24 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2391  PIN (PilT N terminus) domain  47.5 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  47.5 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  52.5 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  45.71 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  45 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  46.15 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  54.29 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  42.86 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  43.18 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  48.78 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  45.24 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  47.62 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>