80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1440 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1440  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  359  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3240  hypothetical protein  65.14 
 
 		 175 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0209036  normal  0.632043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1278  hypothetical protein  53.14 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.175666  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3494  protein of unknown function DUF1178  53.14 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.418231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1419  hypothetical protein  50.86 
 
 		 146 aa  158  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2198  protein of unknown function DUF1178  48 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.381917 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2271  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2150  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0219334  normal  0.395291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1044  hypothetical protein  48 
 
 		 140 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315056  normal  0.288187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1621  hypothetical protein  47.43 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2257  hypothetical protein  47.43 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2233  hypothetical protein  47.43 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1813  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0943  hypothetical protein  47.98 
 
 		 155 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1146  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0969021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0977  hypothetical protein  50.57 
 
 		 152 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0721  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1452  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1315  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.696592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0429  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1077  hypothetical protein  48.59 
 
 		 140 aa  154  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5561  hypothetical protein  47.43 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.320377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1516  hypothetical protein  48.33 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0816575 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1306  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5165  hypothetical protein  51.43 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0887  protein of unknown function DUF1178  49.14 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0972  hypothetical protein  49.14 
 
 		 155 aa  148  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766766  normal  0.625326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1508  hypothetical protein  46.86 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617584  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1875  protein of unknown function DUF1178  46.51 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.464761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1361  protein of unknown function DUF1178  45.14 
 
 		 141 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114069  hitchhiker  0.00762425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3193  hypothetical protein  45.14 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2046  hypothetical protein  47.67 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1993  hypothetical protein  45.71 
 
 		 147 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208822  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4072  hypothetical protein  45.71 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1036  hypothetical protein  41.11 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2033  protein of unknown function DUF1178  42.42 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7597  hypothetical protein  38.92 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3603  protein of unknown function DUF1178  40.96 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3529  protein of unknown function DUF1178  38.1 
 
 		 142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.753668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3820  protein of unknown function DUF1178  38.1 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3967  hypothetical protein  39.18 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2507  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00622099  normal  0.253692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0023  hypothetical protein  41.18 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0046  hypothetical protein  40.7 
 
 		 150 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5214  hypothetical protein  44.91 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0104  hypothetical protein  38.95 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2011  hypothetical protein  38.6 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3477  protein of unknown function DUF1178  40.83 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2040  hypothetical protein  35.47 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5955  protein of unknown function DUF1178  40.85 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3279  hypothetical protein  39.05 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0604  protein of unknown function DUF1178  41.38 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1885  hypothetical protein  34.5 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0517  hypothetical protein  35.2 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0477  hypothetical protein  35.12 
 
 		 147 aa  97.8  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0382  hypothetical protein  34.88 
 
 		 147 aa  97.4  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.122904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1874  hypothetical protein  34.32 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0556  hypothetical protein  36.42 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.09335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1805  hypothetical protein  34.32 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1739  hypothetical protein  33.74 
 
 		 145 aa  94.7  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1051  hypothetical protein  38.15 
 
 		 144 aa  94.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.588494  normal  0.494297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2316  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0942  hypothetical protein  35.9 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  92.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3689  protein of unknown function DUF1178  35.23 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3271  hypothetical protein  35.33 
 
 		 148 aa  87.8  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1031  hypothetical protein  30.99 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107167  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3087  hypothetical protein  36.05 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2057  conserved hypothetical protein DUF1178  35.09 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.321468 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0128  protein of unknown function DUF1178  32.56 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330985  normal  0.0171645 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1789  hypothetical protein  36.75 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0266683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3309  hypothetical protein  31.25 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.358508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0740  hypothetical protein  37.95 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0684748  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1497  hypothetical protein  35.5 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2570  hypothetical protein  33.54 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0177669  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2261  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00456771  normal  0.596265 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0836  protein of unknown function DUF1178  50 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0478  hypothetical protein  34.74 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0383  hypothetical protein  34.04 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>