80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1516 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1516  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  327  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0816575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1419  hypothetical protein  53.12 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2198  protein of unknown function DUF1178  52.83 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.381917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1361  protein of unknown function DUF1178  51.88 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114069  hitchhiker  0.00762425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1875  protein of unknown function DUF1178  54.72 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.464761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3193  hypothetical protein  50.62 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3240  hypothetical protein  49.44 
 
 		 175 aa  154  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0209036  normal  0.632043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1440  hypothetical protein  48.33 
 
 		 175 aa  153  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1315  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.696592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0429  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0721  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1146  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0969021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5561  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.320377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0977  hypothetical protein  52.9 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1452  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1813  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1278  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.175666  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2046  hypothetical protein  53.12 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2271  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1077  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2233  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2257  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1621  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1044  hypothetical protein  49.38 
 
 		 140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315056  normal  0.288187 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1306  hypothetical protein  48.75 
 
 		 140 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0943  hypothetical protein  52.56 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2150  hypothetical protein  48.75 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0219334  normal  0.395291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1993  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208822  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1508  hypothetical protein  51.55 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3494  protein of unknown function DUF1178  48.75 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.418231  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0887  protein of unknown function DUF1178  49.06 
 
 		 155 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0972  hypothetical protein  47.8 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766766  normal  0.625326 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1036  hypothetical protein  43.56 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4072  hypothetical protein  46.88 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5165  hypothetical protein  44.77 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2033  protein of unknown function DUF1178  44.59 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3603  protein of unknown function DUF1178  45 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5214  hypothetical protein  45.1 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2040  hypothetical protein  42.38 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0382  hypothetical protein  39.47 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.122904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7597  hypothetical protein  41.06 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5955  protein of unknown function DUF1178  44.52 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249221  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0556  hypothetical protein  44.81 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.09335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0477  hypothetical protein  39.47 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0046  hypothetical protein  43.23 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3477  protein of unknown function DUF1178  41.03 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3279  hypothetical protein  44.81 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2011  hypothetical protein  39.61 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0104  hypothetical protein  36.02 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1739  hypothetical protein  41.1 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0023  hypothetical protein  34.81 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0128  protein of unknown function DUF1178  40.88 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330985  normal  0.0171645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0517  hypothetical protein  35.26 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0604  protein of unknown function DUF1178  37.04 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1789  hypothetical protein  41.03 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0266683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1874  hypothetical protein  35.76 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1031  hypothetical protein  36.42 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107167  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1805  hypothetical protein  35.76 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3529  protein of unknown function DUF1178  35.1 
 
 		 142 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.753668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3967  hypothetical protein  35.76 
 
 		 142 aa  95.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3087  hypothetical protein  34.52 
 
 		 165 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2507  hypothetical protein  36.73 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00622099  normal  0.253692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3003  hypothetical protein  36.73 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3820  protein of unknown function DUF1178  33.11 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0942  hypothetical protein  38.3 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2261  hypothetical protein  36.3 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00456771  normal  0.596265 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1051  hypothetical protein  37.09 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.588494  normal  0.494297 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1885  hypothetical protein  36.42 
 
 		 145 aa  87.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3689  protein of unknown function DUF1178  34.97 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3271  hypothetical protein  35.62 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2057  conserved hypothetical protein DUF1178  34.84 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.321468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1497  hypothetical protein  37.11 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2316  hypothetical protein  30.12 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2387  hypothetical protein  34.44 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0740  hypothetical protein  34.94 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0684748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3309  hypothetical protein  34.73 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.358508 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0836  protein of unknown function DUF1178  44.12 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2570  hypothetical protein  32.65 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0177669  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0383  hypothetical protein  40.68 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0478  hypothetical protein  41.38 
 
 		 80 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>