80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1885 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1885  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  298  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343226  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1051  hypothetical protein  73.1 
 
 
144 aa  223  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.588494  normal  0.494297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2387  hypothetical protein  70.34 
 
 
144 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2316  hypothetical protein  49.42 
 
 
171 aa  161  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2570  hypothetical protein  52.41 
 
 
139 aa  160  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0177669  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3271  hypothetical protein  47.97 
 
 
148 aa  147  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765913  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2057  conserved hypothetical protein DUF1178  47.47 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.321468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1739  hypothetical protein  47.95 
 
 
145 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1031  hypothetical protein  46.85 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0046  hypothetical protein  48.32 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564208  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2261  hypothetical protein  43.62 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00456771  normal  0.596265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3087  hypothetical protein  41.46 
 
 
165 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0942  hypothetical protein  46.72 
 
 
144 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1805  hypothetical protein  44.68 
 
 
152 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0646662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0517  hypothetical protein  40.37 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_004310  BR1874  hypothetical protein  44.68 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0382  hypothetical protein  45.27 
 
 
147 aa  124  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.122904  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7597  hypothetical protein  41.14 
 
 
160 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3003  hypothetical protein  46.43 
 
 
141 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5214  hypothetical protein  41.4 
 
 
158 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0104  hypothetical protein  40.36 
 
 
167 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0023  hypothetical protein  41.72 
 
 
164 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0477  hypothetical protein  44.52 
 
 
147 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2507  hypothetical protein  46.15 
 
 
142 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00622099  normal  0.253692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3529  protein of unknown function DUF1178  45.83 
 
 
142 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.753668  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3477  protein of unknown function DUF1178  46.15 
 
 
157 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3820  protein of unknown function DUF1178  45.14 
 
 
142 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3967  hypothetical protein  46.15 
 
 
142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5955  protein of unknown function DUF1178  42.48 
 
 
154 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0740  hypothetical protein  41.42 
 
 
177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0684748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3689  protein of unknown function DUF1178  38.27 
 
 
166 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0604  protein of unknown function DUF1178  38.75 
 
 
164 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0128  protein of unknown function DUF1178  37.8 
 
 
168 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330985  normal  0.0171645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3309  hypothetical protein  36.47 
 
 
172 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.358508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3603  protein of unknown function DUF1178  41.72 
 
 
158 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2011  hypothetical protein  38.99 
 
 
159 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1278  hypothetical protein  38.71 
 
 
164 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.175666  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3279  hypothetical protein  40.76 
 
 
158 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1440  hypothetical protein  34.5 
 
 
175 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1497  hypothetical protein  39.46 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0556  hypothetical protein  41.06 
 
 
156 aa  97.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.09335  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3494  protein of unknown function DUF1178  39.86 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.418231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1419  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0154622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2040  hypothetical protein  36.6 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486976  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2257  hypothetical protein  38.41 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1993  hypothetical protein  35.77 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208822  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1875  protein of unknown function DUF1178  40.14 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.464761 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1621  hypothetical protein  38.41 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2233  hypothetical protein  38.41 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5561  hypothetical protein  39.13 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.320377 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2150  hypothetical protein  36.96 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0219334  normal  0.395291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2271  hypothetical protein  37.68 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1077  hypothetical protein  40.88 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4072  hypothetical protein  39.26 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2198  protein of unknown function DUF1178  37.67 
 
 
153 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.381917 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0429  hypothetical protein  40.15 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1452  hypothetical protein  40.15 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1508  hypothetical protein  36.88 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1813  hypothetical protein  40.15 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1146  hypothetical protein  40.15 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0969021  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0721  hypothetical protein  40.15 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1315  hypothetical protein  40.15 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.696592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2033  protein of unknown function DUF1178  36.55 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1044  hypothetical protein  37.14 
 
 
140 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315056  normal  0.288187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1036  hypothetical protein  32.08 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1789  hypothetical protein  36.25 
 
 
159 aa  87.4  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0266683  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1516  hypothetical protein  36.42 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0816575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1361  protein of unknown function DUF1178  35.77 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114069  hitchhiker  0.00762425 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1306  hypothetical protein  39.42 
 
 
140 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3240  hypothetical protein  34.13 
 
 
175 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0209036  normal  0.632043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0887  protein of unknown function DUF1178  37.32 
 
 
155 aa  86.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0972  hypothetical protein  38.03 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766766  normal  0.625326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3193  hypothetical protein  35.77 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5165  hypothetical protein  34.42 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335034  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0943  hypothetical protein  36.11 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292686  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0977  hypothetical protein  36.62 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2046  hypothetical protein  36.23 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0383  hypothetical protein  49.35 
 
 
81 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0478  hypothetical protein  46.75 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3556  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>