27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1918 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  70 
 
 
70 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  70 
 
 
70 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  68.57 
 
 
70 aa  100  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  63.24 
 
 
69 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0773  hypothetical protein  65.71 
 
 
70 aa  93.6  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0830  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000119075  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  52.38 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  52.38 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0142  hypothetical protein  67.92 
 
 
53 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  50.79 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3183  hypothetical protein  55.71 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102788  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3334  hypothetical protein  56.67 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  52.24 
 
 
72 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  53.57 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  41.79 
 
 
81 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4315  hypothetical protein  36.76 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.896102  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2931  hypothetical protein  45.65 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471594  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  40.74 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  37.14 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  37.93 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4469  hypothetical protein  30.14 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  37.93 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0375  hypothetical protein  36.36 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1012  hypothetical protein  34.33 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1793  hypothetical protein  38.18 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0439839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0587  hypothetical protein  36 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125147  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>