22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0587 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0587  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  156  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0375  hypothetical protein  79.49 
 
 		 78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  41.54 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  41.54 
 
 		 70 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  41.54 
 
 		 70 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  38.24 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  43.08 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  38.81 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  36.51 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1012  hypothetical protein  35.21 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  35.29 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  34.38 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  45.83 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  28.12 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  36.92 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2931  hypothetical protein  39.62 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471594  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  31.25 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3334  hypothetical protein  45.83 
 
 		 74 aa  42  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  36.49 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4315  hypothetical protein  36.92 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.896102  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  39.39 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0830  hypothetical protein  32.26 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000119075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>