25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0830 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0830  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  144  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000119075  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  60 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  86.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  60.29 
 
 
69 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  52.86 
 
 
70 aa  84  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0773  hypothetical protein  55.71 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3183  hypothetical protein  47.14 
 
 
71 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102788  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0142  hypothetical protein  61.54 
 
 
53 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3334  hypothetical protein  51.79 
 
 
74 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  46.55 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  46.55 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  46.27 
 
 
72 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  44.26 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  44.83 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  39.66 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4315  hypothetical protein  34.92 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.896102  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  36.36 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  40.98 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0375  hypothetical protein  36.36 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12662  hypothetical protein  44.44 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000362753  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2931  hypothetical protein  42.22 
 
 
55 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471594  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1793  hypothetical protein  42.59 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0439839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>