22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3334 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3334  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  154  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  67.14 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3183  hypothetical protein  66.18 
 
 		 71 aa  88.2  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  62.9 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  56.67 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  56.67 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  56.67 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  53.62 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  51.56 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  51.56 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  51.67 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0830  hypothetical protein  51.79 
 
 		 70 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000119075  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  48.57 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0773  hypothetical protein  53.57 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  50.82 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0142  hypothetical protein  65 
 
 		 53 aa  60.1  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12662  hypothetical protein  49.02 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000362753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  45 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2931  hypothetical protein  46.81 
 
 		 55 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471594  normal  0.223788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>