28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0311 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  98.57 
 
 
70 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  57.63 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  52.38 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  51.61 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  54.24 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  58.33 
 
 
74 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  55.38 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3334  hypothetical protein  51.56 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0773  hypothetical protein  50.85 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  48.57 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0830  hypothetical protein  46.55 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000119075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  53.33 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  51.67 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0142  hypothetical protein  63.41 
 
 
53 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  55.56 
 
 
79 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3183  hypothetical protein  58.14 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4469  hypothetical protein  35.94 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4315  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.896102  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2931  hypothetical protein  47.83 
 
 
55 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471594  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1012  hypothetical protein  31.82 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  36.67 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1793  hypothetical protein  43.48 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0439839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0375  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0587  hypothetical protein  40.82 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125147  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12662  hypothetical protein  46.67 
 
 
140 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000362753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>