27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1346 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  92.86 
 
 		 70 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  70 
 
 		 70 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  68.57 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0773  hypothetical protein  61.43 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  56.52 
 
 		 69 aa  87.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0830  hypothetical protein  52.86 
 
 		 70 aa  84  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000119075  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  55.88 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  51.61 
 
 		 70 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3334  hypothetical protein  56.67 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0142  hypothetical protein  60.38 
 
 		 53 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3183  hypothetical protein  50.7 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102788  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  40.91 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  51.72 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4315  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.896102  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  43.86 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  44.44 
 
 		 74 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  41.38 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1012  hypothetical protein  35.82 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4469  hypothetical protein  35.94 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2931  hypothetical protein  42.86 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471594  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1793  hypothetical protein  38.18 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0439839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0375  hypothetical protein  35.19 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0587  hypothetical protein  36.54 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>