25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0137 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  71.01 
 
 
70 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  63.24 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0773  hypothetical protein  69.57 
 
 
70 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  56.52 
 
 
70 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0830  hypothetical protein  60.29 
 
 
70 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000119075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  56.52 
 
 
70 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3183  hypothetical protein  53.52 
 
 
71 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102788  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0142  hypothetical protein  71.7 
 
 
53 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  54.24 
 
 
70 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  54.24 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  54.24 
 
 
70 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  60.71 
 
 
74 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3334  hypothetical protein  51.67 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  47.06 
 
 
72 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  44.26 
 
 
74 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  39.06 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  44.83 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  43.86 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4315  hypothetical protein  38.46 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.896102  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  44.26 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4469  hypothetical protein  31.75 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1012  hypothetical protein  32.31 
 
 
94 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1793  hypothetical protein  36.36 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0439839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2931  hypothetical protein  34.69 
 
 
55 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471594  normal  0.223788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>