26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3387 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  82.43 
 
 		 74 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  77.03 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  70.27 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3334  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  53.33 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  53.33 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  53.33 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12662  hypothetical protein  62 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000362753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  63.04 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4315  hypothetical protein  40.32 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.896102  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  44.26 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2931  hypothetical protein  49.09 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471594  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  41.38 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3183  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102788  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  36.07 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0830  hypothetical protein  40.98 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000119075  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4469  hypothetical protein  39.39 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0142  hypothetical protein  56.41 
 
 		 53 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0773  hypothetical protein  40.35 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1012  hypothetical protein  38.89 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  37.93 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0375  hypothetical protein  42 
 
 		 78 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>