24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3183 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3183  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  137  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102788  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  70 
 
 
72 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3334  hypothetical protein  66.18 
 
 
74 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  60.56 
 
 
70 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  53.52 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  55.71 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  64.91 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  52.11 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0830  hypothetical protein  47.14 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000119075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  50.7 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0773  hypothetical protein  54.69 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0142  hypothetical protein  65.85 
 
 
53 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  48.61 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  53.12 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  58.14 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  58.14 
 
 
70 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  58.14 
 
 
70 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  52.38 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2931  hypothetical protein  61.11 
 
 
55 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471594  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  38.81 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12662  hypothetical protein  48 
 
 
140 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000362753  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4315  hypothetical protein  35.29 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.896102  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0375  hypothetical protein  42.86 
 
 
78 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>