22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0773 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0773  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  144  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0142  hypothetical protein  92.45 
 
 
53 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  68.57 
 
 
70 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  69.57 
 
 
69 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  65.71 
 
 
85 aa  93.6  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  61.43 
 
 
70 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  61.43 
 
 
70 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0830  hypothetical protein  55.71 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000119075  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  50.85 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  50.85 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3183  hypothetical protein  54.69 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102788  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3334  hypothetical protein  53.57 
 
 
74 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  49.15 
 
 
70 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  48.53 
 
 
72 aa  58.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  51.79 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  40.32 
 
 
81 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  45.28 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4315  hypothetical protein  38.1 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.896102  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  38.6 
 
 
74 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  40.35 
 
 
74 aa  48.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  40.35 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1793  hypothetical protein  38.18 
 
 
73 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0439839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>