18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4469 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4469  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1012  hypothetical protein  65.59 
 
 		 94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4315  hypothetical protein  51.61 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.896102  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4771  hypothetical protein  45.95 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1051  hypothetical protein  35.62 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0763  hypothetical protein  35.94 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3387  hypothetical protein  53.85 
 
 		 74 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0794  hypothetical protein  35.94 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532274  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0311  hypothetical protein  35.94 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0288392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0732  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0822  hypothetical protein  46.81 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0897  hypothetical protein  40.35 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0137  hypothetical protein  31.75 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.458909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1042  hypothetical protein  35.38 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1346  hypothetical protein  35.94 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1918  hypothetical protein  30.14 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1391  hypothetical protein  34.38 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3664  hypothetical protein  31.88 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.01018  hitchhiker  0.0000106855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>