39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1818 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1818    100 
 
 
282 bp  559  1e-157  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.000000259029 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1720  transposase, IS605 OrfB  85.62 
 
 
1266 bp  129  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.720564  normal  0.119776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2016    82.19 
 
 
344 bp  127  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00979161 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1242  Fis family transcriptional regulator  80.75 
 
 
885 bp  123  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.635409  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0288  transposase, IS605 OrfB  84.81 
 
 
1263 bp  123  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.125775  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1447  transposase, IS605 OrfB  80.75 
 
 
1332 bp  123  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.303185  normal  0.469752 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1390  transposase, IS605 OrfB  83.33 
 
 
1383 bp  107  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1224    84.06 
 
 
414 bp  99.6  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.802037  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1064  transposase, IS605 OrfB  82.18 
 
 
1458 bp  99.6  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1840  transposase, IS605 OrfB  80.65 
 
 
1260 bp  97.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.113531  hitchhiker  0.00220366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1279  transposase, IS605 OrfB  81.88 
 
 
1272 bp  89.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1227  transposase, IS605 OrfB  84.48 
 
 
1224 bp  87.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.666406  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1179  transposase, IS605 OrfB  88.75 
 
 
1251 bp  87.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0122    89.33 
 
 
4039 bp  85.7  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.44906  normal  0.010671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0124  transposase IS605 OrfB  89.33 
 
 
1254 bp  85.7  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00276741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0005  transposase, IS605 OrfB  81.6 
 
 
1281 bp  85.7  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.741123  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1033  transposase, IS605 OrfB  90 
 
 
1323 bp  83.8  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000086107 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1003    89.19 
 
 
374 bp  83.8  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.539082  hitchhiker  0.000396797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0607  hypothetical protein  100 
 
 
393 bp  83.8  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000187155 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0147  transposase, IS605 OrfB  83.33 
 
 
276 bp  83.8  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1099    88.16 
 
 
536 bp  79.8  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.928435  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1059  transposase, IS605 OrfB  79.53 
 
 
480 bp  77.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0862  hypothetical protein  91.53 
 
 
384 bp  77.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.106662 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0801  hypothetical protein  91.53 
 
 
384 bp  77.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336215 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1530  IS605 family transposase OrfB  90.48 
 
 
1242 bp  77.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0242937  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1030  transposase, IS605 OrfB  86.08 
 
 
291 bp  69.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000210924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0120  hypothetical protein  84.62 
 
 
327 bp  69.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0850335  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0333  transposase, IS605 OrfB  91.84 
 
 
1257 bp  65.9  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.107927  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1065  transposase, IS605 OrfB  88.33 
 
 
426 bp  63.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1718    86.76 
 
 
240 bp  63.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.859175  decreased coverage  0.00000624689 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0586  transposase IS605 OrfB  89.8 
 
 
1242 bp  58  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.732197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1046  transposase, IS605 OrfB  89.58 
 
 
522 bp  56  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0261063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0243  transposase, IS605 OrfB  84.51 
 
 
1257 bp  56  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.13657  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0158  transposase, IS605 OrfB  83.54 
 
 
237 bp  54  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1382  transposase, IS605 OrfB  84.85 
 
 
1206 bp  52  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1007  hypothetical protein  91.89 
 
 
276 bp  50.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0572948  hitchhiker  0.0000560019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1414  transposase, IS605 OrfB  85 
 
 
1251 bp  48.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0641  paREP12  88.64 
 
 
270 bp  48.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000929061  hitchhiker  0.00106451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0112  paREP12  86.54 
 
 
249 bp  48.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>