39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1224 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1224    100 
 
 
414 bp  821    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.802037  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0147  transposase, IS605 OrfB  88.51 
 
 
276 bp  186  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1279  transposase, IS605 OrfB  80.27 
 
 
1272 bp  149  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0801  hypothetical protein  97.56 
 
 
384 bp  147  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336215 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0862  hypothetical protein  97.56 
 
 
384 bp  147  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.106662 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1227  transposase, IS605 OrfB  89.43 
 
 
1224 bp  141  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.666406  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1064  transposase, IS605 OrfB  79.51 
 
 
1458 bp  133  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1059  transposase, IS605 OrfB  91.4 
 
 
480 bp  121  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1840  transposase, IS605 OrfB  91.4 
 
 
1260 bp  121  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.113531  hitchhiker  0.00220366 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1718    88.89 
 
 
240 bp  119  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.859175  decreased coverage  0.00000624689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0005  transposase, IS605 OrfB  85.29 
 
 
1281 bp  111  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.741123  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1818    84.06 
 
 
282 bp  99.6  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.000000259029 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0282  transposase, IS605 OrfB  91.55 
 
 
438 bp  93.7  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0548229  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1720  transposase, IS605 OrfB  83.58 
 
 
1266 bp  91.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.720564  normal  0.119776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1007  hypothetical protein  88.76 
 
 
276 bp  89.7  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0572948  hitchhiker  0.0000560019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1447  transposase, IS605 OrfB  83.21 
 
 
1332 bp  89.7  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.303185  normal  0.469752 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1242  Fis family transcriptional regulator  83.21 
 
 
885 bp  89.7  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.635409  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1731  transposase, IS605 OrfB  83.09 
 
 
981 bp  87.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1099    85.05 
 
 
536 bp  85.7  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.928435  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1046  transposase, IS605 OrfB  87.64 
 
 
522 bp  81.8  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0261063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0122    84.11 
 
 
4039 bp  77.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.44906  normal  0.010671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0124  transposase IS605 OrfB  84.11 
 
 
1254 bp  77.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00276741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0288  transposase, IS605 OrfB  84.16 
 
 
1263 bp  73.8  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.125775  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0112  paREP12  81.56 
 
 
249 bp  73.8  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210379  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1382  transposase, IS605 OrfB  86.42 
 
 
1206 bp  73.8  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0111  hypothetical protein  91.07 
 
 
624 bp  71.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.140009  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0641  paREP12  81.25 
 
 
270 bp  71.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000929061  hitchhiker  0.00106451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1414  transposase, IS605 OrfB  87.32 
 
 
1251 bp  69.9  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1390  transposase, IS605 OrfB  80.88 
 
 
1383 bp  63.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1189    83.16 
 
 
267 bp  61.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1462  transposase, IS605 OrfB  88.68 
 
 
1266 bp  58  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1033  transposase, IS605 OrfB  84.21 
 
 
1323 bp  56  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000086107 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1179  transposase, IS605 OrfB  79.72 
 
 
1251 bp  54  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0243  transposase, IS605 OrfB  80.49 
 
 
1257 bp  54  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.13657  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0298  hypothetical protein  81.37 
 
 
222 bp  52  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1065  transposase, IS605 OrfB  86.79 
 
 
426 bp  50.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0941    90.24 
 
 
1031 bp  50.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.275882  hitchhiker  0.000128584 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1380    91.67 
 
 
156 bp  48.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.638331  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0644  transposase, IS605 OrfB  91.67 
 
 
1263 bp  48.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0667565  hitchhiker  0.00187927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>