24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1718 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1718    100 
 
 
240 bp  476  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.859175  decreased coverage  0.00000624689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1447  transposase, IS605 OrfB  89.29 
 
 
1332 bp  254  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.303185  normal  0.469752 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1242  Fis family transcriptional regulator  89.29 
 
 
885 bp  254  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.635409  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1720  transposase, IS605 OrfB  91.28 
 
 
1266 bp  192  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.720564  normal  0.119776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0288  transposase, IS605 OrfB  87.16 
 
 
1263 bp  143  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.125775  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1227  transposase, IS605 OrfB  90.65 
 
 
1224 bp  133  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.666406  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1064  transposase, IS605 OrfB  94.05 
 
 
1458 bp  127  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1224    88.89 
 
 
414 bp  119  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.802037  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1059  transposase, IS605 OrfB  94.37 
 
 
480 bp  109  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1840  transposase, IS605 OrfB  95.16 
 
 
1260 bp  99.6  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.113531  hitchhiker  0.00220366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1279  transposase, IS605 OrfB  93.55 
 
 
1272 bp  91.7  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1033  transposase, IS605 OrfB  84.11 
 
 
1323 bp  77.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000086107 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1007  hypothetical protein  95.35 
 
 
276 bp  69.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0572948  hitchhiker  0.0000560019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1099    91.67 
 
 
536 bp  63.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.928435  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1414  transposase, IS605 OrfB  85.53 
 
 
1251 bp  63.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1818    86.76 
 
 
282 bp  63.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.000000259029 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1046  transposase, IS605 OrfB  93.02 
 
 
522 bp  61.9  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0261063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0147  transposase, IS605 OrfB  90 
 
 
276 bp  60  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0282  transposase, IS605 OrfB  83.78 
 
 
438 bp  52  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0548229  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0333  transposase, IS605 OrfB  86.79 
 
 
1257 bp  50.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.107927  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0586  transposase IS605 OrfB  86.79 
 
 
1242 bp  50.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.732197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1189    83.33 
 
 
267 bp  48.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1731  transposase, IS605 OrfB  93.55 
 
 
981 bp  46.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0243  transposase, IS605 OrfB  91.43 
 
 
1257 bp  46.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.13657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>