62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2906 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.594021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  74.02 
 
 		 128 aa  206  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  65.35 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  58.27 
 
 		 127 aa  174  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2157  hypothetical protein  48.03 
 
 		 142 aa  135  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1435  hypothetical protein  38.89 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.436424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  34.13 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  35.2 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  32.52 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  29.27 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  32.23 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  30.58 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  30.58 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  30.28 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  31.97 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  29.57 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  30.16 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  29.91 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  29.06 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  29.06 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1946  putative lipoprotein  24.6 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  26.83 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  26.04 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  25.21 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  27.56 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  27.56 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  26.21 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  22.96 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  26.56 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  25.64 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0511  protein of unknown function DUF302  22.5 
 
 		 214 aa  47  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000589231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  29.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  25.64 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  25.64 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0905  hypothetical protein  25.66 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.342547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  25.64 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  27.42 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  27.93 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  28 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  27.64 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  30.85 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0488  hypothetical protein  23.38 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  29.17 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  25.2 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  26.42 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  26.42 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  23.64 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  26.36 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  28.72 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  33.33 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  22.76 
 
 		 350 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  27.19 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  25 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  25 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  26.83 
 
 		 137 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  22.52 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0330  hypothetical protein  23.4 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  24.11 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  28.33 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  28.33 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  28.33 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  27.43 
 
 		 128 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>