69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2146 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  259  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  45.6 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  38.21 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  35.77 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  35.48 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  32.52 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.594021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  30.17 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1435  hypothetical protein  32.52 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.436424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  30.4 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  30.28 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  31.19 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  28.95 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  27.97 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  32.77 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  32.77 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1892  protein of unknown function DUF302  33.03 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  39.51 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  31.78 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  31.48 
 
 		 130 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  28.93 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  28.93 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  32.26 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3053  hypothetical protein  28.7 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  31.82 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  31.82 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  31.82 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  25.64 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  30.36 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  33.72 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  30.17 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  27.35 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  30.56 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  28.95 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0772  hypothetical protein  28.89 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  29.29 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  31.43 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  29.29 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  24.79 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0905  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.342547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0488  hypothetical protein  24.71 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  30.97 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  26.85 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  29.29 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  27.62 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  29.52 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0330  hypothetical protein  28.89 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  27.35 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  29.09 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1910  hypothetical protein  29.59 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  27.12 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  29.09 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  27.12 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  23.68 
 
 		 280 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  32.58 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  25.62 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  25.62 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  25.62 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  23.01 
 
 		 280 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2773  protein of unknown function DUF302  27.72 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0128668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  22.12 
 
 		 350 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3686  hypothetical protein  31.11 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.829007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  26.96 
 
 		 137 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  28.21 
 
 		 154 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  26.74 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>