73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0504 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  268  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  268  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  268  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  70.54 
 
 
137 aa  189  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  70.59 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  69.53 
 
 
131 aa  184  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  64.34 
 
 
133 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  64.34 
 
 
133 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  64.34 
 
 
133 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  65.12 
 
 
131 aa  166  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  63.85 
 
 
137 aa  163  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  63.85 
 
 
137 aa  163  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  63.08 
 
 
137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  57.14 
 
 
141 aa  156  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0357  protein of unknown function DUF302  49.22 
 
 
143 aa  126  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  48.12 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  47.73 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  51.56 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  48.09 
 
 
133 aa  121  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2575  protein of unknown function DUF302  46.56 
 
 
144 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000565546  decreased coverage  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3831  hypothetical protein  47.69 
 
 
140 aa  120  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  45.8 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  47.24 
 
 
128 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  43.85 
 
 
131 aa  114  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  43.18 
 
 
131 aa  110  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1892  protein of unknown function DUF302  46.56 
 
 
134 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  40.62 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  47.29 
 
 
128 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  47.29 
 
 
128 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  45.45 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  45.45 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  67.57 
 
 
128 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  67.57 
 
 
128 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  46.34 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  43.08 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  60.24 
 
 
128 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  44.09 
 
 
128 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  48.82 
 
 
128 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2773  protein of unknown function DUF302  40.77 
 
 
132 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  38.76 
 
 
138 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  43.31 
 
 
128 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  40.16 
 
 
129 aa  100  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1910  hypothetical protein  46.55 
 
 
114 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  43.55 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3686  hypothetical protein  38.93 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.829007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  40.15 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  40.8 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  39.42 
 
 
135 aa  97.1  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3053  hypothetical protein  44.09 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  42.52 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  39.39 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  39.39 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  39.69 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  39.69 
 
 
280 aa  93.6  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  38.93 
 
 
280 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4222  protein of unknown function DUF302  57.89 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  41.46 
 
 
136 aa  90.9  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3468  hypothetical protein  36.09 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0266  protein of unknown function DUF302  39.56 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4277  protein of unknown function DUF302  41.98 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.486441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  37.04 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3325  protein of unknown function DUF302  41.77 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.847441  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2611  protein of unknown function DUF302  36 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  32.48 
 
 
132 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  26.67 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  29.23 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  27.87 
 
 
127 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  27.05 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  26.89 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  22.69 
 
 
350 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  25.62 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1946  putative lipoprotein  23.36 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  28.33 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.594021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>