79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2887 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  100 
 
 
127 aa  265  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  52.14 
 
 
132 aa  133  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  35.94 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  38.39 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  34.13 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.594021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  32.8 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  36.97 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  35 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  30.17 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  32 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1892  protein of unknown function DUF302  30.83 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  31.4 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1435  hypothetical protein  36.84 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.436424  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2773  protein of unknown function DUF302  33.33 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  32.52 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  32.52 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  32.52 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  35.25 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  37.72 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  29.6 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  30.47 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  32.46 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  30.47 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2157  hypothetical protein  28 
 
 
142 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  37.72 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  29.27 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  37.72 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3831  hypothetical protein  31.78 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  29.13 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  29.03 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  33.6 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  30.89 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  28.35 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3053  hypothetical protein  30.16 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  30.71 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3468  hypothetical protein  26.4 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  27.56 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  28.33 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3686  hypothetical protein  33.6 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.829007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  27.97 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  33.9 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0357  protein of unknown function DUF302  29.6 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  33.06 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  25.98 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2575  protein of unknown function DUF302  29.84 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000565546  decreased coverage  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  30.23 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4222  protein of unknown function DUF302  32.76 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  27.35 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  30.83 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  26.67 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  25.83 
 
 
280 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  26.67 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  26.67 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  23.62 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  26.61 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  26.79 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  26.79 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  26.61 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2611  protein of unknown function DUF302  33.33 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4277  protein of unknown function DUF302  35.05 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.486441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  34.25 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  28.7 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3325  protein of unknown function DUF302  33.33 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.847441  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  25.98 
 
 
280 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  26.61 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1910  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468377  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0266  protein of unknown function DUF302  31.76 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  29.82 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  30.25 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0905  hypothetical protein  21.3 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.342547  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1309  hypothetical protein  22.86 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00449501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  27.47 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0511  protein of unknown function DUF302  24.53 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000589231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  27.05 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>