71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2890 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  259  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  66.41 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  58.59 
 
 
128 aa  159  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  60.94 
 
 
128 aa  158  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  57.81 
 
 
129 aa  157  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3053  hypothetical protein  57.81 
 
 
129 aa  155  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  53.54 
 
 
133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1910  hypothetical protein  58.93 
 
 
114 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468377  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  48.44 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  48.44 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  46.09 
 
 
131 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  42.06 
 
 
280 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  48.82 
 
 
128 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  42.06 
 
 
280 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  46.03 
 
 
128 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  45.67 
 
 
132 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  48.82 
 
 
128 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  42.96 
 
 
143 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  43.75 
 
 
131 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  43.65 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2773  protein of unknown function DUF302  42.86 
 
 
132 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  44.96 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  47.58 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  46.77 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  46.77 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  43.94 
 
 
135 aa  110  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1892  protein of unknown function DUF302  42.86 
 
 
134 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  44.53 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3686  hypothetical protein  40.48 
 
 
132 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.829007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  47.27 
 
 
128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  44.78 
 
 
131 aa  103  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  53.57 
 
 
133 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  53.57 
 
 
133 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  53.57 
 
 
133 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  43.31 
 
 
135 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  43.31 
 
 
135 aa  100  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  43.31 
 
 
135 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  45.38 
 
 
141 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  44.78 
 
 
137 aa  100  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  38.58 
 
 
131 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2575  protein of unknown function DUF302  40.16 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000565546  decreased coverage  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  39.37 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  41.54 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  41.54 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  41.54 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  37.8 
 
 
135 aa  97.4  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  40.52 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  40.52 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4222  protein of unknown function DUF302  52.5 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0357  protein of unknown function DUF302  38.89 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  51.76 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  43.14 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3831  hypothetical protein  37.59 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3468  hypothetical protein  33.86 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  35 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  32.03 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3325  protein of unknown function DUF302  45.57 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.847441  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4277  protein of unknown function DUF302  44.58 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.486441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  40.74 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0266  protein of unknown function DUF302  39.24 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  38.26 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2611  protein of unknown function DUF302  34.82 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  30.83 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  28.33 
 
 
130 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  29.17 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.594021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  32.58 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  27.55 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  26.19 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1946  putative lipoprotein  26.61 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>