44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1946 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1946  putative lipoprotein  100 
 
 		 154 aa  320  7e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  26.98 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  29.31 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  29.31 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  29.31 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  34.62 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  28.07 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  24.6 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.594021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  26.09 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  23.77 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  30.19 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  30.19 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  25.42 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  24.19 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  30.95 
 
 		 280 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  29.37 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  22.95 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  29.07 
 
 		 280 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  26.17 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  28.16 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  20.33 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  28.16 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  24.79 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  32.79 
 
 		 130 aa  44.3  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  31.94 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  20.8 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3831  hypothetical protein  32.71 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0905  hypothetical protein  29.84 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.342547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  26.61 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  24.59 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  23.66 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  21.77 
 
 		 127 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  22.22 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  24.37 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  24.37 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  23.68 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  23.68 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  22.22 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  22.22 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  24.37 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  22.22 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>