78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1964 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  94.29 
 
 		 280 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  57.58 
 
 		 132 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3686  hypothetical protein  57.58 
 
 		 132 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.829007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2773  protein of unknown function DUF302  56.82 
 
 		 132 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  48.41 
 
 		 128 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  47.62 
 
 		 131 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  46.83 
 
 		 128 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  47.62 
 
 		 131 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1910  hypothetical protein  56.19 
 
 		 114 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  45.31 
 
 		 133 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  46.92 
 
 		 130 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  42.06 
 
 		 128 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  42.06 
 
 		 129 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1892  protein of unknown function DUF302  44.44 
 
 		 134 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  44.72 
 
 		 135 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  46.03 
 
 		 128 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  40.31 
 
 		 135 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  42.24 
 
 		 138 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  41.73 
 
 		 133 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  41.73 
 
 		 133 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  41.73 
 
 		 133 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  45.69 
 
 		 136 aa  105  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  40.71 
 
 		 129 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  39.37 
 
 		 141 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  41.38 
 
 		 123 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  42.48 
 
 		 129 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  42.48 
 
 		 129 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2206  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  39.68 
 
 		 131 aa  102  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3053  hypothetical protein  39.84 
 
 		 129 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  39.68 
 
 		 131 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  39.68 
 
 		 131 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  39.37 
 
 		 137 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  39.37 
 
 		 137 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  39.37 
 
 		 137 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  40.19 
 
 		 128 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  40.19 
 
 		 128 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  39.82 
 
 		 128 aa  95.5  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  39.82 
 
 		 128 aa  95.5  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  39.69 
 
 		 135 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  39.69 
 
 		 135 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  39.69 
 
 		 135 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  36.89 
 
 		 131 aa  93.2  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2575  protein of unknown function DUF302  36.51 
 
 		 144 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000565546  decreased coverage  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  38.76 
 
 		 137 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  37.21 
 
 		 131 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  43.3 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0357  protein of unknown function DUF302  34.92 
 
 		 143 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  37.29 
 
 		 143 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  38.33 
 
 		 134 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3468  hypothetical protein  37.17 
 
 		 129 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  38.76 
 
 		 135 aa  89.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  36.13 
 
 		 142 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3831  hypothetical protein  35.11 
 
 		 140 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  37.62 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4222  protein of unknown function DUF302  48.53 
 
 		 127 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3436  hypothetical protein  34.78 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000030286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0825  hypothetical protein  34.78 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1017  hypothetical protein  23.47 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.200293 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3325  protein of unknown function DUF302  36.9 
 
 		 146 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.847441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4277  protein of unknown function DUF302  30.89 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.486441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  33.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  27.68 
 
 		 132 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2611  protein of unknown function DUF302  32.38 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0266  protein of unknown function DUF302  34.48 
 
 		 148 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  27.19 
 
 		 128 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  25.98 
 
 		 127 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1435  hypothetical protein  25.2 
 
 		 131 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.436424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  27.19 
 
 		 127 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1269  protein of unknown function DUF302  30.11 
 
 		 154 aa  49.3  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  21.6 
 
 		 130 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1946  putative lipoprotein  30.95 
 
 		 154 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  23.64 
 
 		 127 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.594021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  23.01 
 
 		 128 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  21.93 
 
 		 127 aa  42.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>