75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4400 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  259  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  70.4 
 
 
128 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  62.4 
 
 
129 aa  161  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  56.69 
 
 
133 aa  159  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  60.94 
 
 
128 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3053  hypothetical protein  62.5 
 
 
129 aa  156  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  53.12 
 
 
128 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1910  hypothetical protein  66.36 
 
 
114 aa  148  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468377  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  51.2 
 
 
131 aa  133  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  49.61 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2773  protein of unknown function DUF302  49.61 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  50.79 
 
 
128 aa  130  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  50.79 
 
 
128 aa  130  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  48.41 
 
 
280 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  54.76 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  54.76 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  50.38 
 
 
131 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3686  hypothetical protein  47.62 
 
 
132 aa  126  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.829007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2575  protein of unknown function DUF302  49.21 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000565546  decreased coverage  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  46.03 
 
 
280 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  48.09 
 
 
137 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  47.69 
 
 
131 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1892  protein of unknown function DUF302  46.72 
 
 
134 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  47.69 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0357  protein of unknown function DUF302  46.83 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  51.72 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  49.59 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  46.97 
 
 
142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  48.36 
 
 
128 aa  116  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  45.24 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  55.34 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  47.24 
 
 
135 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  47.24 
 
 
135 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  44.63 
 
 
129 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  47.24 
 
 
135 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  46.09 
 
 
138 aa  114  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  43.9 
 
 
131 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  47.79 
 
 
129 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  47.79 
 
 
129 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  44.62 
 
 
137 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  44.62 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  44.62 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  45.9 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  45.9 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  45.67 
 
 
135 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  45.38 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  45.38 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  45.38 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  46.28 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  41.94 
 
 
136 aa  107  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  40.62 
 
 
131 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3831  hypothetical protein  41.54 
 
 
140 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  42.06 
 
 
130 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  36.72 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  40.48 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  41.27 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4222  protein of unknown function DUF302  52.5 
 
 
127 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3468  hypothetical protein  35.43 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  37.98 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3325  protein of unknown function DUF302  40.22 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.847441  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4277  protein of unknown function DUF302  38.89 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.486441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  36.36 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  30.71 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2611  protein of unknown function DUF302  34.12 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  32 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0266  protein of unknown function DUF302  34.62 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1946  putative lipoprotein  28.7 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1269  protein of unknown function DUF302  27.66 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  27.83 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  29.52 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  26.09 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  31.03 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1435  hypothetical protein  24.19 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.436424  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  28.72 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.594021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0330  hypothetical protein  20.51 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>