77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2156 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  61.9 
 
 		 128 aa  170  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  56.25 
 
 		 130 aa  157  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  57.36 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  57.36 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1892  protein of unknown function DUF302  51.94 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  54.26 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  51.18 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  48.87 
 
 		 133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0357  protein of unknown function DUF302  51.97 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  50.78 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  52.8 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  52.8 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2575  protein of unknown function DUF302  50.79 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000565546  decreased coverage  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  48.46 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3053  hypothetical protein  50.39 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  46.83 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  47.73 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  47.73 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  47.73 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  48.84 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  48.84 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  46.03 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  50.39 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  46.09 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  48.84 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  51.22 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  51.22 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  45.8 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  44.44 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  45.45 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  45.24 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  46.51 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  46.46 
 
 		 137 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  46.46 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  46.51 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  46.51 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  50.43 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  45.67 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  45.6 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  44.96 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  46.77 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1910  hypothetical protein  48.21 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468377  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  49.17 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  49.17 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3831  hypothetical protein  46.77 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  42.52 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  48.65 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  44.35 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3468  hypothetical protein  43.55 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2773  protein of unknown function DUF302  41.94 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3686  hypothetical protein  43.65 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.829007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  40.16 
 
 		 280 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  39.68 
 
 		 280 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  42.42 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4222  protein of unknown function DUF302  57.69 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  39.84 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  38.26 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  29.03 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  28.69 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  34.09 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3325  protein of unknown function DUF302  38.64 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.847441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2611  protein of unknown function DUF302  34.62 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0266  protein of unknown function DUF302  33.71 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4277  protein of unknown function DUF302  36.36 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.486441  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  28.69 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1435  hypothetical protein  26.15 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.436424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  28.12 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  26.83 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.594021 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  31.13 
 
 		 350 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  24.79 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  31.43 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0905  hypothetical protein  20.77 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.342547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  29.63 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  31.18 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  25.93 
 
 		 172 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>