23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0905 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0905  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  345  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.342547  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  30.93 
 
 
130 aa  58.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0511  protein of unknown function DUF302  23.97 
 
 
214 aa  51.2  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000589231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  25 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1435  hypothetical protein  24.74 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.436424  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  25 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  25.44 
 
 
127 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  25.66 
 
 
127 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.594021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  29.13 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  21.3 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  24.78 
 
 
127 aa  45.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  20.77 
 
 
131 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  22.61 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  26.85 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1946  putative lipoprotein  29.46 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0450  hypothetical protein  26.8 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  26.67 
 
 
131 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  26.67 
 
 
131 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  28.69 
 
 
350 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  29.82 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  28.7 
 
 
130 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  28.97 
 
 
129 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  28.97 
 
 
129 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>