45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1272 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  244  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  50.43 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  38.74 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  38.84 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  35.54 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  38.14 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  35.71 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  41.1 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  41.1 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  40.66 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  37.38 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  39.58 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  32.08 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  34.82 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  34.82 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  36.17 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  33.03 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  34.95 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  29.36 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  35.71 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  26.05 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  31.25 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  34.78 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  29.63 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  29.73 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  33.93 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  35.37 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  63.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  32.38 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  34.26 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  26.85 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  38.57 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  25.41 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  33.33 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  30.86 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  36.23 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  37.66 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  28 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  28.16 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  25 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  22.77 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  26.74 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>