33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2901 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2901  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35360  hypothetical protein  56.54 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101497  normal  0.0806512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2980  hypothetical protein  56.15 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26880  hypothetical protein  54.9 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0781566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2565  xylose isomerase domain-containing protein  53.64 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743333  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3379  xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.92 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2379  xylose isomerase domain-containing protein  51.95 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2568  xylose isomerase domain-containing protein  52.76 
 
 		 259 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0060  xylose isomerase domain-containing protein  38.46 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0170  xylose isomerase domain-containing protein  38.64 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3415  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.66 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1487  xylose isomerase domain-containing protein  36.22 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1254  xylose isomerase domain-containing protein  34.92 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1747  xylose isomerase domain-containing protein  32.82 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1734  xylose isomerase domain-containing protein  32.82 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6345  xylose isomerase-like TIM barrel  32.82 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1655  xylose isomerase domain-containing protein  34.13 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.131538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1655  xylose isomerase domain-containing protein  34.13 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.71258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0755  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.12 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0689  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.12 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.208396  normal  0.278119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5030  xylose isomerase-like TIM barrel  31.87 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2295  hypothetical protein  33.07 
 
 		 350 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0500  sugar phosphate isomerase/epimerase  32.75 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0428613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1525  xylose isomerase domain-containing protein  32.94 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394526  normal  0.900622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.29 
 
 		 296 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1979  putative epimerase, KguE-like  31.47 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0445694 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1669  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.91 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000240726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2289  AP endonuclease  33.33 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1802  hypothetical protein  25.96 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0128  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.83 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.334205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>