28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1802 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1802  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1669  sugar phosphate isomerase/epimerase  31.02 
 
 
253 aa  120  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000240726  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0500  sugar phosphate isomerase/epimerase  30.17 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0428613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1487  xylose isomerase domain-containing protein  27.89 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0170  xylose isomerase domain-containing protein  28.08 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0060  xylose isomerase domain-containing protein  29.02 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2901  xylose isomerase-like TIM barrel  25.96 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26880  hypothetical protein  27.2 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0781566  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0128  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.44 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.334205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35360  hypothetical protein  24.53 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101497  normal  0.0806512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3415  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.82 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2980  hypothetical protein  23.95 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3379  xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.62 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2565  xylose isomerase domain-containing protein  27.31 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743333  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2379  xylose isomerase domain-containing protein  25.21 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1655  xylose isomerase domain-containing protein  23.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.131538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1655  xylose isomerase domain-containing protein  22.94 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.71258  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1254  xylose isomerase domain-containing protein  25.12 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2568  xylose isomerase domain-containing protein  23.04 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661441  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0755  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.52 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1734  xylose isomerase domain-containing protein  21.12 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6345  xylose isomerase-like TIM barrel  21.12 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1747  xylose isomerase domain-containing protein  21.12 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.907837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.38 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991144  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0689  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.51 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.208396  normal  0.278119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1979  putative epimerase, KguE-like  23.53 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0445694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1525  xylose isomerase domain-containing protein  20.48 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394526  normal  0.900622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5030  xylose isomerase-like TIM barrel  25.21 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>