33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0128 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0128  sugar phosphate isomerase/epimerase  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.334205  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1669  sugar phosphate isomerase/epimerase  38.31 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000240726  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0500  sugar phosphate isomerase/epimerase  37.92 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0428613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1487  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0060  xylose isomerase domain-containing protein  29.33 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3415  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.75 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0170  xylose isomerase domain-containing protein  28.69 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35360  hypothetical protein  28.19 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101497  normal  0.0806512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1254  xylose isomerase domain-containing protein  30.28 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26880  hypothetical protein  27.06 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0781566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2379  xylose isomerase domain-containing protein  28.21 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3379  xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.21 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2980  hypothetical protein  29.09 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1802  hypothetical protein  26.44 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2565  xylose isomerase domain-containing protein  26.38 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743333  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2568  xylose isomerase domain-containing protein  25.81 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1734  xylose isomerase domain-containing protein  26.32 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6345  xylose isomerase-like TIM barrel  26.32 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1747  xylose isomerase domain-containing protein  25.88 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0689  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.208396  normal  0.278119 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0755  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.82 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2901  xylose isomerase-like TIM barrel  26.83 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1525  xylose isomerase domain-containing protein  25.95 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394526  normal  0.900622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1655  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.131538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1979  putative epimerase, KguE-like  27.36 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0445694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5030  xylose isomerase-like TIM barrel  25.27 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1655  xylose isomerase domain-containing protein  26.57 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.71258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.96 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2295  hypothetical protein  26.47 
 
 		 350 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2097  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2155  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2289  AP endonuclease  25 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0960  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>