33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1655 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1655  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.131538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1655  xylose isomerase domain-containing protein  97.24 
 
 		 254 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.71258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1747  xylose isomerase domain-containing protein  83.86 
 
 		 280 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1734  xylose isomerase domain-containing protein  83.86 
 
 		 280 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6345  xylose isomerase-like TIM barrel  83.86 
 
 		 280 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1525  xylose isomerase domain-containing protein  85.43 
 
 		 254 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394526  normal  0.900622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5030  xylose isomerase-like TIM barrel  85.04 
 
 		 254 aa  370  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0689  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  65.23 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.208396  normal  0.278119 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0755  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  63.67 
 
 		 256 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1254  xylose isomerase domain-containing protein  62.99 
 
 		 254 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2295  hypothetical protein  69.29 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.9 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1979  putative epimerase, KguE-like  62.85 
 
 		 257 aa  248  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0445694 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0960  hypothetical protein  67.66 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2289  AP endonuclease  67.23 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2155  hypothetical protein  67.23 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2097  hypothetical protein  66.81 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1487  xylose isomerase domain-containing protein  39.52 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0170  xylose isomerase domain-containing protein  38.91 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0060  xylose isomerase domain-containing protein  37.92 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2901  xylose isomerase-like TIM barrel  34.13 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26880  hypothetical protein  36.9 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0781566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35360  hypothetical protein  35.46 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101497  normal  0.0806512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2568  xylose isomerase domain-containing protein  38.08 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3379  xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.92 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2565  xylose isomerase domain-containing protein  38.33 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743333  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2379  xylose isomerase domain-containing protein  37.5 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3415  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.25 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2980  hypothetical protein  35.83 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0500  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.54 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0428613  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0128  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.71 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.334205  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1669  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.46 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000240726  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1802  hypothetical protein  22.71 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>