33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1979 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1979  putative epimerase, KguE-like  100 
 
 
257 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0445694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  89.11 
 
 
296 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991144  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1254  xylose isomerase domain-containing protein  65.61 
 
 
254 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1655  xylose isomerase domain-containing protein  62.85 
 
 
254 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.131538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1747  xylose isomerase domain-containing protein  61.57 
 
 
280 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.907837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1734  xylose isomerase domain-containing protein  61.57 
 
 
280 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6345  xylose isomerase-like TIM barrel  61.57 
 
 
280 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1655  xylose isomerase domain-containing protein  62.06 
 
 
254 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.71258  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1525  xylose isomerase domain-containing protein  64.03 
 
 
254 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394526  normal  0.900622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0689  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.25 
 
 
256 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.208396  normal  0.278119 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0755  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.08 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5030  xylose isomerase-like TIM barrel  63.1 
 
 
254 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2295  hypothetical protein  59.52 
 
 
350 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0960  hypothetical protein  59.23 
 
 
254 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2289  AP endonuclease  58.8 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2155  hypothetical protein  58.8 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2097  hypothetical protein  58.37 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1487  xylose isomerase domain-containing protein  38.08 
 
 
271 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0170  xylose isomerase domain-containing protein  36.14 
 
 
253 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26880  hypothetical protein  37.45 
 
 
260 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0781566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3415  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.92 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0060  xylose isomerase domain-containing protein  35.57 
 
 
250 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3379  xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.82 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2379  xylose isomerase domain-containing protein  37.39 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2565  xylose isomerase domain-containing protein  37.61 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743333  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2980  hypothetical protein  33.07 
 
 
260 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35360  hypothetical protein  34.26 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101497  normal  0.0806512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2568  xylose isomerase domain-containing protein  35.15 
 
 
259 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2901  xylose isomerase-like TIM barrel  32.02 
 
 
260 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0128  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.39 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.334205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0500  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.48 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0428613  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1669  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.47 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000240726  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1802  hypothetical protein  23.53 
 
 
253 aa  52.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>