33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_26880  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0781566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35360  hypothetical protein  65.77 
 
 		 260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101497  normal  0.0806512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2980  hypothetical protein  64.62 
 
 		 260 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3379  xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.86 
 
 		 259 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2565  xylose isomerase domain-containing protein  56.97 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743333  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2379  xylose isomerase domain-containing protein  56.47 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2568  xylose isomerase domain-containing protein  59.23 
 
 		 259 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2901  xylose isomerase-like TIM barrel  54.9 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0060  xylose isomerase domain-containing protein  44.31 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3415  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.32 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1487  xylose isomerase domain-containing protein  39.53 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0170  xylose isomerase domain-containing protein  39.15 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1254  xylose isomerase domain-containing protein  37.7 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0755  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.74 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.99218  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0689  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.94 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.208396  normal  0.278119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1655  xylose isomerase domain-containing protein  36.9 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.131538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1747  xylose isomerase domain-containing protein  32.54 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1655  xylose isomerase domain-containing protein  35.71 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.71258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1734  xylose isomerase domain-containing protein  32.14 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6345  xylose isomerase-like TIM barrel  32.14 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2279  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.32 
 
 		 296 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1979  putative epimerase, KguE-like  36.6 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0445694 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0500  sugar phosphate isomerase/epimerase  32.44 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0428613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1525  xylose isomerase domain-containing protein  34.13 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.394526  normal  0.900622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2295  hypothetical protein  38.4 
 
 		 350 aa  98.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5030  xylose isomerase-like TIM barrel  31.75 
 
 		 254 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1669  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.3 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000240726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2097  hypothetical protein  40.7 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0960  hypothetical protein  40.7 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2155  hypothetical protein  40.7 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2289  AP endonuclease  40.7 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0128  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.06 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.334205  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1802  hypothetical protein  27.2 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>