21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0388 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0455  polyhydroxyalkanoic acid system protein  60.44 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0870141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4884  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  60 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5010  hypothetical protein  60 
 
 		 111 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5149  hypothetical protein  58.89 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5060  polyhydroxyalkanoic acid system protein  58.89 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66890  hypothetical protein  60 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5801  hypothetical protein  60 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0524  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  52.22 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.434716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0390  hypothetical protein  56.67 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3414  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  46.67 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2542  polyhydroxyalkanoic acid system protein  43.33 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00484477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00721  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  37.78 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3503  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  36.26 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0338  polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.04 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.988819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2381  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  30.85 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3086  hypothetical protein  35.11 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.185956 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1172  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  30.77 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3533  hypothetical protein  31.58 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3378  hypothetical protein  29.17 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1266  hypothetical protein  26.67 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00853794  normal  0.0139586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>