19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0338 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0338  polyhydroxyalkanoic acid system protein  100 
 
 		 105 aa  214  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.988819  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3503  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  51.06 
 
 		 110 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4034  hypothetical protein  46.88 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3533  hypothetical protein  45.74 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3086  hypothetical protein  44.79 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.185956 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1172  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  43.62 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2381  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  38.55 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66890  hypothetical protein  34.74 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5801  hypothetical protein  34.74 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0455  polyhydroxyalkanoic acid system protein  36.17 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0870141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0388  hypothetical protein  34.04 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4884  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  35.79 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5010  hypothetical protein  35.79 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5060  polyhydroxyalkanoic acid system protein  35.79 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0524  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.74 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.434716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0390  hypothetical protein  34.38 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2542  polyhydroxyalkanoic acid system protein  32.22 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00484477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3414  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  28.72 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>