19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3086 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3086  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.185956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4034  hypothetical protein  52.94 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3533  hypothetical protein  54.95 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3503  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  56.38 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0338  polyhydroxyalkanoic acid system protein  44.79 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.988819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1172  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  43.62 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66890  hypothetical protein  41.05 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5801  hypothetical protein  41.05 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2381  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  33.33 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0388  hypothetical protein  35.16 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3414  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  33.33 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4884  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.74 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5060  polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.74 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5010  hypothetical protein  34.74 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2542  polyhydroxyalkanoic acid system protein  32.22 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00484477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0524  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.74 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.434716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0455  polyhydroxyalkanoic acid system protein  32.97 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0870141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0390  hypothetical protein  31.25 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5149  hypothetical protein  30.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>