23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0524 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0524  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  100 
 
 		 91 aa  180  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.434716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5801  hypothetical protein  62.64 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66890  hypothetical protein  62.64 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0455  polyhydroxyalkanoic acid system protein  54.44 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0870141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5010  hypothetical protein  54.95 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4884  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  54.95 
 
 		 109 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0388  hypothetical protein  52.22 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5060  polyhydroxyalkanoic acid system protein  52.75 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5149  hypothetical protein  46.15 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3414  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  48.86 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0390  hypothetical protein  46.15 
 
 		 92 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2542  polyhydroxyalkanoic acid system protein  40 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00484477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00721  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  40.66 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0338  polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.74 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.988819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2381  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  32.98 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3503  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.07 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1172  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  30.43 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4034  hypothetical protein  29.67 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3086  hypothetical protein  34.74 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.185956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3533  hypothetical protein  31.58 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3378  hypothetical protein  34.38 
 
 		 105 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3183  hypothetical protein  34.12 
 
 		 105 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3507  hypothetical protein  34.12 
 
 		 105 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>