19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3503 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3503  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3533  hypothetical protein  58.88 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4034  hypothetical protein  60 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3086  hypothetical protein  56.25 
 
 		 115 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.185956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0338  polyhydroxyalkanoic acid system protein  49.51 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.988819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1172  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  38.04 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66890  hypothetical protein  39.56 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5801  hypothetical protein  39.56 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2381  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.74 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3414  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  37.5 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0388  hypothetical protein  36.26 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0524  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.07 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.434716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0390  hypothetical protein  32.29 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0455  polyhydroxyalkanoic acid system protein  28.57 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0870141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5010  hypothetical protein  28.57 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2542  polyhydroxyalkanoic acid system protein  32.22 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00484477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4884  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  28.57 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5060  polyhydroxyalkanoic acid system protein  28.57 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5149  hypothetical protein  29.17 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>