19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5060 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5060  polyhydroxyalkanoic acid system protein  100 
 
 		 91 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5010  hypothetical protein  97.8 
 
 		 111 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4884  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  97.8 
 
 		 109 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0455  polyhydroxyalkanoic acid system protein  91.11 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0870141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0388  hypothetical protein  58.89 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0524  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  52.75 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.434716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66890  hypothetical protein  52.75 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5801  hypothetical protein  52.75 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5149  hypothetical protein  51.65 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0390  hypothetical protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3414  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  35.56 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2542  polyhydroxyalkanoic acid system protein  36.67 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00484477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0338  polyhydroxyalkanoic acid system protein  35.79 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.988819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00721  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.07 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3086  hypothetical protein  34.74 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.185956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3503  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  28.57 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4034  hypothetical protein  26.32 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1172  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  30.43 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3533  hypothetical protein  27.66 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>