20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5149 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5149  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  183  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0390  hypothetical protein  89.13 
 
 		 92 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0388  hypothetical protein  58.89 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0455  polyhydroxyalkanoic acid system protein  53.33 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0870141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4884  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  52.75 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5010  hypothetical protein  52.75 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0524  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  46.15 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.434716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5060  polyhydroxyalkanoic acid system protein  51.65 
 
 		 91 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66890  hypothetical protein  41.76 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5801  hypothetical protein  41.76 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2542  polyhydroxyalkanoic acid system protein  37.78 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00484477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3414  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  33.7 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00721  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  32.97 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0338  polyhydroxyalkanoic acid system protein  33.33 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.988819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2381  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  30.85 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3086  hypothetical protein  30.21 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.185956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3503  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  29.67 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3378  hypothetical protein  28.89 
 
 		 105 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0499  hypothetical protein  31.76 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1172  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  26.09 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>