25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3378 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3378  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3507  hypothetical protein  89.52 
 
 		 105 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3183  hypothetical protein  89.52 
 
 		 105 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0721  hypothetical protein  57.14 
 
 		 104 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1476  hypothetical protein  53.33 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0708  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541154  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0402  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0459082  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4169  hypothetical protein  43.81 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3800  hypothetical protein  46.67 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0337  hypothetical protein  41.9 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3683  hypothetical protein  43.81 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.812045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6327  hypothetical protein  41.9 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.426865  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1878  hypothetical protein  43.64 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3488  hypothetical protein  42.73 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1266  hypothetical protein  43.93 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00853794  normal  0.0139586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1573  hypothetical protein  41.94 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0499  hypothetical protein  33.66 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1283  hypothetical protein  32.61 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0455  polyhydroxyalkanoic acid system protein  28.12 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0870141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4884  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  32.14 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.961245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0524  putative polyhydroxyalkanoic acid system protein  34.38 
 
 		 91 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.434716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5149  hypothetical protein  28.89 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5010  hypothetical protein  32.14 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0388  hypothetical protein  29.17 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2957  hypothetical protein  27.84 
 
 		 97 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.599538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>