83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0729 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0729  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  725    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0740  hypothetical protein  81.58 
 
 
345 aa  568  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1169  hypothetical protein  30.56 
 
 
263 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1170  hypothetical protein  30.9 
 
 
264 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1240  hypothetical protein  30.56 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3380  hypothetical protein  29.32 
 
 
263 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3207  hypothetical protein  29.28 
 
 
274 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3064  hypothetical protein  28.57 
 
 
274 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1313  protein of unknown function DUF1365  28.62 
 
 
274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.91577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3050  hypothetical protein  28.62 
 
 
274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0639  hypothetical protein  32.86 
 
 
269 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000143987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01817  hypothetical protein  33.81 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2710  hypothetical protein  28.29 
 
 
269 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.784131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1483  hypothetical protein  29.26 
 
 
267 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3032  hypothetical protein  29.84 
 
 
273 aa  105  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0801667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1327  hypothetical protein  31.8 
 
 
242 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003862  hypothetical protein  34.41 
 
 
272 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2773  hypothetical protein  32.67 
 
 
239 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725138  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1384  hypothetical protein  30.26 
 
 
272 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01432  hypothetical protein  28.76 
 
 
247 aa  99  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1002  hypothetical protein  27.92 
 
 
249 aa  96.7  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.160897  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2099  hypothetical protein  28.09 
 
 
241 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658996  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3369  hypothetical protein  29.41 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1488  hypothetical protein  31.32 
 
 
240 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1486  hypothetical protein  28.95 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.735841  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0873  hypothetical protein  31.35 
 
 
243 aa  86.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1176  protein of unknown function DUF1365  31.69 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01778  hypothetical protein  25.84 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0815  hypothetical protein  27.88 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4071  hypothetical protein  23.05 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0461  hypothetical protein  21.56 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3174  hypothetical protein  23.3 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186988  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2097  hypothetical protein  24.15 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0957  hypothetical protein  24.45 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0491  hypothetical protein  27.8 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6582  hypothetical protein  29.89 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4740  hypothetical protein  21.95 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1117  hypothetical protein  24.02 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4723  protein of unknown function DUF1365  24 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2467  hypothetical protein  26.32 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3018  hypothetical protein  23.47 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1067  hypothetical protein  23.78 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0235  hypothetical protein  28.24 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2735  hypothetical protein  23.13 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103828  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0128  hypothetical protein  26.4 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48601  predicted protein  26.78 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5829  hypothetical protein  30.06 
 
 
284 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3432  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0349  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.86 
 
 
656 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5885  hypothetical protein  23.81 
 
 
250 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192815  normal  0.239276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1054  protein of unknown function DUF1365  23.91 
 
 
256 aa  60.1  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2970  hypothetical protein  24.09 
 
 
272 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  0.71112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2397  protein of unknown function DUF1365  23.81 
 
 
272 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1955  protein of unknown function DUF1365  34.78 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1046  protein of unknown function DUF1365  26.79 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.616737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0463  hypothetical protein  26.47 
 
 
276 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2938  hypothetical protein  36.17 
 
 
249 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064452  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0912  hypothetical protein  25.14 
 
 
254 aa  56.2  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4727  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6097  hypothetical protein  27.98 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0297528  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10454  hypothetical protein  21.43 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4019  hypothetical protein  34.83 
 
 
254 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0326  hypothetical protein  26.09 
 
 
250 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101488  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1870  hypothetical protein  25.12 
 
 
268 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.651772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1090  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein  28 
 
 
249 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3584  protein of unknown function DUF1365  29.36 
 
 
254 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.33232  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1450  hypothetical protein  21.43 
 
 
261 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2753  hypothetical protein  34.04 
 
 
249 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.948566  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1972  hypothetical protein  24.71 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2905  hypothetical protein  21.59 
 
 
283 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0413  hypothetical protein  29.95 
 
 
259 aa  46.2  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00475452  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0101  protein of unknown function DUF1365  29.46 
 
 
265 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00443517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0368  protein of unknown function DUF1365  32.58 
 
 
252 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0087  hypothetical protein  26.34 
 
 
267 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3572  hypothetical protein  21.18 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1442  protein of unknown function DUF1365  21.57 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4268  protein of unknown function DUF1365  26.9 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1251  protein of unknown function DUF1365  23.84 
 
 
291 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00207378  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1389  hypothetical protein  23.7 
 
 
257 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0272  hypothetical protein  26.13 
 
 
258 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.944039  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2839  protein of unknown function DUF1365  21.15 
 
 
281 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2121  protein of unknown function DUF1365  29.17 
 
 
260 aa  43.5  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000114198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2024  protein of unknown function DUF1365  22.77 
 
 
265 aa  43.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0297  protein of unknown function DUF1365  26.55 
 
 
263 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>