78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0740 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0740  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  725    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0729  hypothetical protein  81.58 
 
 		 346 aa  592  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1169  hypothetical protein  30.33 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1170  hypothetical protein  30.67 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3380  hypothetical protein  30.56 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1240  hypothetical protein  29.9 
 
 		 263 aa  122  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0639  hypothetical protein  35.45 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000143987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1313  protein of unknown function DUF1365  29 
 
 		 274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.91577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3050  hypothetical protein  29 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3064  hypothetical protein  29 
 
 		 274 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01817  hypothetical protein  32.84 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3207  hypothetical protein  28.33 
 
 		 274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01432  hypothetical protein  31.1 
 
 		 247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2710  hypothetical protein  29.24 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.784131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1483  hypothetical protein  33.64 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1327  hypothetical protein  28.9 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003862  hypothetical protein  33.87 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3032  hypothetical protein  30.82 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0801667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2773  hypothetical protein  36.51 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725138  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1384  hypothetical protein  31.53 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3369  hypothetical protein  28.1 
 
 		 274 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1488  hypothetical protein  32.42 
 
 		 240 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1002  hypothetical protein  28.15 
 
 		 249 aa  97.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.160897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2099  hypothetical protein  27.2 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1176  protein of unknown function DUF1365  30.9 
 
 		 247 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0873  hypothetical protein  31.89 
 
 		 243 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1486  hypothetical protein  26.38 
 
 		 300 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.735841  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0461  hypothetical protein  25.65 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0815  hypothetical protein  26.09 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3174  hypothetical protein  24.92 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0957  hypothetical protein  25.12 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01778  hypothetical protein  25.91 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4071  hypothetical protein  25.12 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2097  hypothetical protein  27.22 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5885  hypothetical protein  28.02 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192815  normal  0.239276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4740  hypothetical protein  24.44 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1067  hypothetical protein  24.5 
 
 		 266 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1117  hypothetical protein  24.42 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2970  hypothetical protein  25.17 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  0.71112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2397  protein of unknown function DUF1365  25.17 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0235  hypothetical protein  26.79 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3018  hypothetical protein  26.63 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0349  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.67 
 
 		 656 aa  69.3  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0491  hypothetical protein  25.16 
 
 		 254 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2735  hypothetical protein  26.13 
 
 		 269 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4723  protein of unknown function DUF1365  27.78 
 
 		 269 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6582  hypothetical protein  28.49 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2467  hypothetical protein  23.24 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1955  protein of unknown function DUF1365  26.23 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0128  hypothetical protein  24.87 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1450  hypothetical protein  24.5 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3432  hypothetical protein  27.71 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0463  hypothetical protein  23.38 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48601  predicted protein  26.46 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5829  hypothetical protein  27.38 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1046  protein of unknown function DUF1365  27.11 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.616737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1054  protein of unknown function DUF1365  23.86 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3584  protein of unknown function DUF1365  25.84 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.33232  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0912  hypothetical protein  25.27 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2938  hypothetical protein  27.72 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064452  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1442  protein of unknown function DUF1365  24.07 
 
 		 283 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4019  hypothetical protein  27.5 
 
 		 254 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1972  hypothetical protein  25.6 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10454  hypothetical protein  23.03 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6097  hypothetical protein  25.6 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0297528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0101  protein of unknown function DUF1365  27.13 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00443517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1870  hypothetical protein  20.68 
 
 		 268 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0087  hypothetical protein  25.81 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2436  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  19.21 
 
 		 658 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1090  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein  33.33 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0326  hypothetical protein  22.16 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0368  protein of unknown function DUF1365  24.73 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2753  hypothetical protein  32.29 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.948566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3572  hypothetical protein  24.47 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2121  protein of unknown function DUF1365  30.21 
 
 		 260 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000114198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1251  protein of unknown function DUF1365  23.81 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00207378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1621  protein of unknown function DUF1365  23.28 
 
 		 283 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4268  protein of unknown function DUF1365  25 
 
 		 257 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.624218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>