54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0569 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  74.15 
 
 
150 aa  237  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  71.43 
 
 
147 aa  229  1e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  71.43 
 
 
147 aa  228  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  49.66 
 
 
143 aa  135  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  38.03 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  39.57 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  38.52 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  38.73 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  36.17 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  38.58 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  33.57 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  35.97 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  33.57 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  34.53 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  34.53 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  36.03 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  32.17 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  34.44 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  31.29 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  30.28 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  35.54 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  31.25 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  27.89 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  32.54 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  28.87 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  29.29 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  30.5 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  26.97 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  33.57 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  31.65 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  32.87 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  32.41 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0902  hypothetical protein  28.77 
 
 
163 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  32.62 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0373  protein of unknown function DUF101  32.14 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  29.2 
 
 
136 aa  53.5  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  27.86 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40293  predicted protein  32.59 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  31.03 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  28.17 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  31.03 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  29.63 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  28.38 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
542 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  27.86 
 
 
136 aa  43.9  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  26.67 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  27.94 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  29.03 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2028  protein of unknown function DUF101  26.71 
 
 
152 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595059  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  23.89 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>